Az Escherichia coli, röviden E. coli által 2011. május−júniusában okozott járvány legvalószínűbb felelőse: Németországban csíráztatott bab. Ezt a hírt német hatóságok adták közre június 5-én.
A gyanu úgy terelődött a csíráztatott babra, hogy a megbetegedések alapos kivizsgálása után ez bizonyult a fertőzési esetek egyetlen közös vonásának.
A halálos E. coli betegekből történt izolálását azonnal követte a baktérium alapos vizsgálata és genomjának feltérképezése. A Hamburgi Egyetemi Orvosi Centrum (University Medical Centre Hamburg-Eppendorf) és a kínai BGI-Shenzhen (korábban Beijingi Genetikai Intézet) együttes erővel 3 nap alatt szekvenáltátk meg a baktérium genomját, hogy kiderítsék mely gének felelősek az ismeretlen E. coli humánpatogén (emberre fertőző) viselkedéséért. (A kólibaktériumok a normál bélflóra tagjaiként alapvetően nem patogének, de rokonaik, pl. a Salmonellák, Shigellák és és elfajzott törzseik igen)
A szekvencia adatok alapján az a szakértők véleménye az, hogy ez egy teljesen új E. coli törzs, egy szuper-toxikus és fertőzőképes rekombináns, mely valószínűleg horizontális géntranszfer útján jött létre. Ez azt jelenti, hogy egy korábban ártalmatlan E. coli idegen géneket vett át más baktériumoktól, pl. humán-patogén rokonaitól. (A horizontális kifejezés arra utal, hogy nem ivaros szaporodás során jutott − például a szüleitől − új génekhez, hanem a vele egy közösségben élő vagy éppen elpusztult baktériumból származó gént vett fel.)
A genom mérete: 5,2 Mb (5,2 millió bázispár). A génjei között azonosították a Shiga-toxin génjét, emiatt ez egy STEC (Shiga-Toxin termelő E. coli), szerotípusa O 104. Ez egy új szerotípus, ami azt jelenti, hogy az emberi immunrendszernek teljesen újfajta antitestet kell termelnie a baktérium legyőzéséhez.
A korábban azonosított és szekvenált baktériumok közül a legjobban, 93%-ban, az EAEC 55989 E. colihoz hasonlít, egy szintén veszélyes patogén és amelyet néhány évvel ezelőtt a Középafrikai Köztársaságban izoláltak.
A középafrikaihoz képest ez az új STEC az egészségre veszélyes géneken kívül szép számban tartalmaz antibiotikum-rezisztencia géneket is, ami nehezíti a gyógyszeres kezelést. Rezisztens az amino glikozidázokra, a makrolid antibiotikumokra és a a béta-laktám (penicillin-származékok) típusúakra is.
Legveszélyesebb génje az embernél, főként a gyerekeknél végzetes HUS-betegségért felelős. A HUS: hemolytic-uremic syndrome, azaz hemolitikus-urémiás szidróma, a vörösvértestek szétesését, véres székletet és vizelet eredményező betegség. A HUS-t ebben az eseteben (HUS mástól is lehet) egy verotoxin típusú toxikus fehérje (Shiga-toxin) okozza, mely a vörösvértestek és vese károsodásával járó súlyos rendellenesség. A baktérium közvetlen hatása tulajdonképpen az erek epitélium-sejtjeinek tönkretételét jelenti, a többi tünet az epitélium-sejtek funkciójának kieséséből következik.
Az új E. coli törzs szekvencia-adatait már betették az NCBI adatbázisba (SRA No: SRA037315.1) mely letölthető az alábbi weboldalról: ftp://ftp.gnomics.org.cn/pub/Ecoli_TY-2482