BACMAP - Baktérium Genom Atlasz

Kép forrása
http://bacmap.wishartlab.com/
Leírás szerzője
Szűcs Andrea

BACMAP

Genom Atlasz

Interaktív vizuális adatbázis, ami több száz baktérium teljesen feltárt genetikai információját tartalmazza.

A genetikai térképek között 1790 baktérium 2989 kromoszómájának térképét találhatjuk meg.

A kromoszóm térképeket nagyíthatjuk és forgathatjuk is.

A genomhoz és génalkotóhoz különböző bioinformatikai programokat és webes eszközöket használ a BacMap, hogy a grafikus és szöveges információt könnyen ki tudjuk nyerni az adatbázisból.

Minden baktérium kromoszóma térképe mellett megtalálható a tRNS, illetve rRNS térkép is. Az egyes bakteriális kromoszóma bejegyzések garfikonokat és táblázatokat is tartalmaznak az alkotó génekről és a fehérjékről is.  

A géntérképek hivatkozásokat is tartalmaznak, melyek részletesebb leírásokhoz vezetnek.

A térképeket kereshetjük manuálisan és a BacMap kereső segítségével.

Az egyes baktérium fajokról írásos összefoglaló található a honlapon.

A gén, illetve fehérje szekvenciákat letölthetjük.

 A BacMap egy nemzetközi, angol nyelvű adatbázis.  Jól áttekinthető, könnyű használni, felhasználóbarát, még jelentősebb angol nyelvtudás sem szükséges hozzá. Az adatbázist az Albertai Egyetem Wishart csoportja fejleszti és gondozza.

Szerző által felhasznált források

http://bacmap.wishartlab.com/