A gombafonalak behatolnak a sejtközötti járatokba és magukba a sejtekbe is. Az endomikorrhizák egyik jellegzetes megjelenési formája, amikor a növényi sejtekbe belépő gombafonalak megvastagodásokat (vezikulumokat) és elágazó képleteket (arbuszkulumokat) képeznek. Az arbuszkulumok a gomba és a gazdanövény közötti tápanyagcsere fő színhelyei.
Ez a kapcsolat mindkét résztvevő számára előnyös, mivel a gombának így heterotróf életmódot élhetnek, nem fotoszintetizálnak, nem tudják előállítani saját szerves anyagaikat. Azzal hogy a növények sejtjeit körbeveszik vagy azokba behatolnak, közvetlenül jut hozzá a növény által előállított szerves anyagokhoz. A növények gyökereit a gombafonalak körbeveszik és a sok hajszálvékony gombafonal nagyobb felszívási felszínt biztosít a növénynek, így hatékonyabban tudja felvenni a talajból a tápanyagokat.