Az ökoszisztémát közvetlen módon is károsan befolyásolja a legtöbb légszennyező anyag, a nitrogénoxidok és kéndioxid, melyekből a savas esők keletkeznek, a por, a porszemcsékre kötődött toxikus anyagok, az illó szerves szennyezőanyagok. A savas esők egész erdőségeket pusztítanak ki, a szennyezett por rárakódik a növényekre és beszívják az állatok, az illó szerves anyagok közül jó néhány növénytoxikus. A rovarok is érzékenyek a belégzéssel szervezetükbe kerülő szerves anyagokra. Közvetett módon a vizek és a talajok levegőből savas esővel vagy por lerakódásával történő szennyezés veszélyezteti illetve károsítja az ökoszisztémát.